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【蛋白的傅里叶红外光谱图】蛋白的傅里叶红外光谱图及蛋白质红外特征峰

承天示优官方账号 2023-04-28 资讯 656 views 0

在化学和生物领域中,人们经常研究大分子如蛋白质的结构。尤其是对于蛋白质来说,理解其结构非常重要,因为它能够揭示相关功能和行为,并帮助我们设计新药物。

而一项有用的技术是将材料暴露于傅里叶变换红外(FTIR)光谱仪中进行测试。这种方法可以测量样品与不同波长下吸收、散射或透过光线之间的相互作用。当我们向样品加入偏振器以改变3D空间方向时,这个技术越发地更具信息性。

然后研究人员通过比较检测结果来确定某些区域内原子键的状态、聚合度等许多重要参数。以下介绍了关于使用FTIR技术识别蛋白质结构和性质方面更详细内容。

1. 蛋白淀粉样本制备

首先需要制备好可供测量的标准化处理好且易操作的试板。通常情况下我们使用凝胶电泳(SDS-PAGE)的蛋白样品,可以将其制成片状。在这里我们介绍一种简单的方法:直接涂布法。

你所需要的材料有:手套(穿好!)、蛋白、氧化铝试片和非常干燥且无任何污染物的环境。

1. 在洁净表面上放置斑点并均匀地挤压至它大概3到5毫米甚至更小。

2. 按平面填充样本半球形, 并尽可能使得每一个区域都有同等数量和体积地联分子。

3. 样本晾干或加速性晒干,然后可用FTIR对它进行扫描测试。

2. 红外吸收谱

红外光谱是以cm^-1作为频率单位测定来自样品中原子键振动引起震荡衰变释放出来能量波长之间光线交互作用。相比于质谱仪等其他技术去识别生命大分子,FTIR提供了更高层次信息,并且不会损伤样品。

通常而言,在3500-3200 cm^-1附近摆动峰覆盖所有水合位点;在2900–2800 cm^-1总是看到反映CH^2-、CH^3-基团的伸展振动波峰。其他重要区域包括:carbonyl C=O(1620–1680cm^-1),amide I(1600–1700 cm^-1)和amide II和III (1485–1585 cm -1)。

其中,amides是由脂肪族氨基酸组成,在转化峰中具有特别复杂且信息密集的影响,因为它们容易发生变形并与周围原子键之间产生相互作用。

另外值得一提的还有Peptide bond carbonyl stretch所表示出来的单个结构组件可以透露出其所有氨基酸残余物之间关系是否稳定地确立起来了。

3. 特征峰及其解释

我们在上面简述过几个典型存在于红外吸收谱中物质表现形式。这里将从更细节层次去补充讲解实际应用领域内比较常见,并且会被FTIR系统自主绘制出来悬挂於岗位监测器上做参数跟踪而引起注意力的若干条线条:

Amide A Bands (3500 – 3300cm^{-1}): 这些带子通常代表着每个氨基酸的脂肪族NH伸缩振动,通常与水合位点有关。非常便于判定样品是否在原始结构中固态。

Amide B Bands (3065–3010 cm^-1): 这些线段其实代表了相邻社区内的不同方式CH^3 torsion振动模式,直觉上来看它的弧形边缘也很容易识别,并且包含尖峰能量反应等重要信息。

Amide I Band (1700 – 1600cm^{-1}): Amide-I带是最复杂和分析度极高的一个peptide bond拉伸谱区域。只要为手头存在多种可能性下去组成了几乎所有传统结构类型(Cα) 端取向都提供了一层清晰可见基质轮廓解析效果(如 β-sheet或者 α-helix对比就非常明显)。

Amide II Band (1585-1485cm^{-1}: Amide-II带所分布出酰胺硬化曲率、剪裁以及NH deflection/rocking与。。C-NH相关链条交互作用, 直接联系着蛋白质中各类功能性片断之间互联范式稳定程度等方面因素状况感知。

总体而言,利用FTIR技术可以检测蛋白质的结构和特性,尤其是这些组分关于如何与周围化学物质互动、侵入排斥方面表现出来的显著差异状态。公认的优点包括高效快速地检测转换情况以及无损伤处理样品本身的良好性。因此FTIR技术值得深入去探究,并且不断更新最新成果迭代实践中。

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